教學體制
　　學校堅持教育要"三個面向"的原則，不斷完善"以學生發展為本"的教育教學體制，積極與國際教育接軌，吸納發達國家的先進教育理念和先進教育方法，融匯中西教育精粹，為學生提供優質的教育教學服務。在美國普林斯頓大學國際教育中心和美國楊伯翰大學的協助下，創出了嶄新的中英文雙語教學模式。學校從美國、加拿大等國聘請了66位高學歷、高素質的外籍教師;從國內聘請了250多位高職稱、高素質的中方教學人員，在幾乎所有學科課程中都分別由中文教師和外籍教師用中英文兩種語言授課，實施雙語教學，并采用了國際上的小班制和英(漢)語培訓中心強化訓練。學校還與加拿大曼尼托巴省教育廳合作辦學，旨在培養高素質的"精通雙語、學貫中西"的能夠參與國際合作和國際競爭的復合型人才，為國內外大學輸送優秀學生，使他們成為未來的"建設祖國、振興中華"的杰出人才。
管理系統
　　學校實施理事會領導下和校監指導協調下的校長負責制。校理事長是全國政協委員、"中國彭磷基教育基金會"會長、香港愛國企業家、廣東祈福集團總經理彭磷基先生。校監由留美歸國博士擔任。校務委員會由中外籍名校長、教育專家擔任，中西合璧，統籌協調。學校堅持依法治校，以德治校，制度管理和人文關懷并重，創造良好的制度環境和人才成長環境。學校建立了"以學校發展為本"的現代化、國際化的管理系統/模式、治理結構和內部制度，組建了社區-家庭-學校互動機制，校內師生的教學、生活、財務、安全、醫療、營養膳食等均有專業部門，遵章負責。良好的校風，和諧的校園，遐邇聞名。
辦學成效
　　辦學至今歷時10年，取得了"融匯中西、雙語并進"的良好效果和顯著的辦學成效。2001年獲得當今世界上較具權威的國際教育資格評審機構 ---"國際和全美教育資格評審委員會"(CITA)的評審資格，率先成為廣東省唯一的國際級民辦學校，并于2006年5月通過復評。學校先后通過區、市、省一級幼兒園和學校評審;在2003年廣東十佳民辦學校評選活動中榮膺"十佳";被廣東省教育廳評為"廣東省先進民辦學校";被廣東省民政廳評為"全省先進民間組織";被陳香梅教科文獎辦公室、中國成人教育協會授予"中國民辦教育創新與發展貢獻獎"。
學校在民辦教育中一向處于領先位置，倍受社會各界人士和中外教育專家的一致推崇，在海內外有廣泛的知名度。他們盛贊"祈福英語實驗學校完全可以媲美當今世界上許多國家里的較好的學校!"，"祈福英語實驗學校是亞洲英語教學較好的學校!"，"祈福英語實驗學校學生是來自亞洲的美式英語較純熟的學生!"，"民辦學校的楷模，公辦學校的借鑒"。